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南京环境科学研究所是环境保护部的直属科研单位，以农村环境、自然和生态保护科学研究为方向，开展农村生态、自然保护、乡镇工业污染防治和农用化学品污染防治等方面的研究；承担有关农村环境和自然生态保护的国家科技攻关项目和环境保护重点科研项目，为环境保护部的农村环境管理和自然生态管理提供科学依据、技术支持和服务，并协助制定和实施有关规划与计划，参加有关领域的国际合作。
南京环境科学研究所下设8个二级机构：
科研机构：生态保护研究室、自然保护与生物多样性研究室、农用化学品污染与防治研究室、农村环境管理与污染防治研究室；
技术服务机构：环境工程设计与技术开发中心、环境评价与技术咨询中心；
行政职能机构：办公室，科技处，华东环境保护督查中心办公室
地址：江苏省南京市蒋王庙街8号
邮编：210042
联系电话：025-5412926
传真：025-5411611
网址：http://www.nies.org
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