2006年7月，重庆市机构编制委员会批复同意重庆市环境监察处（挂重庆市环境监察总队、重庆市12369环保举报受理中心牌子）更名为重庆市环境监察总队（挂重庆市12369环保举报受理中心牌子），机构规格由处级升格为副局级，由市环保局管理。核定重庆市环境监察总队内设机构6个，即：办公室、环境应急与事故调查处、法规处、稽查处、环境监察一处、环境监察二处。核定重庆市环境监察总队单位领导职数4名，其中副局级1名；处级领导职数12名。原人员编制、经费渠道不变。