截至2007年11月底，环保专项行动共出动228万人次，检查企业100万家次，查处环境违法案件1.7万件，全国挂牌督办5505件，追究责任人576名。
2007年，国家环保总局等国务院七部门深入开展环保专项行动，清理了2000年以来在饮用水源二级保护区内建设的排污口，集中解决工业园区内建设项目“三同时”执行不力问题，关闭不符合产业政策的涉铅企业，关停1.7万吨/年以下化学制浆生产线。
深入开展饮用水源保护区整治。全国共检查集中式饮用水源地1.5万个，划定及调整饮用水源保护区9478个，取缔关闭一级保护区排污口942个，停建停产2000年以来在生活饮用水地表水源二级保护区内新建、扩建项目1194个，限期治理未达标排放企业931个。
深入开展工业园区环境违法问题整治。全国共检查各类工业园区2250个，其中有1136个已经完成规划环评，约占总数的50％。检查园区内建设项目约12万个，环境影响评价执行率约为95％，“三同时”执行率约为61％。园区内现有生产经营企业约15.6万家，污染物达标排放率约76％。
开展对涉铅和造纸等重点行业的专项执法检查。各地共检查涉铅企业1617家，关停282家，1288家主要污染物实现达标排放。检查造纸企业6000余家，停产整治620家，限期完善治污设施企业403家。通过强化治污设施管理，预计减排COD约30万吨，通过采取关闭取缔不符合产业政策的制浆能力等措施，预计减排COD约8万吨。
重点查办了国务院和环保总局领导批示的群众反映强烈的环境污染问题。2007年重点查办了松花江流域污染整治、安徽蚌埠仇岗村等环境污染案件14件，环保总局领导批示件170多件。
督察督办了淮河、黄河、松花江等重点流域区域环境污染问题。共检查136个工业园区、621家重点污染企业和133个河流断面水质。2007年7月，对5个工业园区实行“流域限批”，对38家污染企业挂牌督办。同时，环保总局环监局还联合西北督查中心等单位，对晋陕蒙宁4省区电石铁合金、焦炭等高耗能行业清理整顿情况进行了检查，共抽查企业40余家。
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